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疟疾细胞图像数据集

时间:2019-03-21
数据类型:图形图像 热度
★★★★☆

文件类型: .zip              文件大小:337 MB

授权方式: 公共开源     发布时间:2019-03-21

数据来源:美国国家医学图书馆             界面语言:英文

数据介绍:

该页面包含来自Malaria Screener研究活动的薄血涂片幻灯片图像的分段细胞库。Lister Hill国家生物医学通信中心(LHNCBC)是国家医学图书馆(NLM)的一部分,研究人员开发了一种符合标准的移动应用程序,以减轻资源受限区域显微镜专家的负担并提高诊断准确性。 Android智能手机连接到传统的光学显微镜。收集来自150只恶性疟原虫感染的和50名健康患者的Giemsa染色的薄血涂片载玻片并在孟加拉国吉大港医学院医院拍照。智能手机的内置摄像头为每个微观视野获取了幻灯片图像。图像由泰国曼谷Mahidol-Oxford热带医学研究单位的专家幻灯片阅读器手动注释。去识别的图像和注释在NLM(IRB#12972)存档。我们应用基于水平集的算法来检测和分割红细胞。该数据集包含总共27,558个细胞图像,具有相同的寄生和未感染细胞实例。这里示出了如何将患者ID编码到细胞名称中的实例:“P1”表示标记为“C33P1thinF_IMG_20150619_114756a_cell_179.png”的细胞的患者ID。我们还将包含Patient-ID的CSV文件包含在寄生和未感染类的细胞映射中。寄生类的CSV文件包含151个患者ID条目。从两种不同的显微镜模型(Olympus和Motif)读取寄生的患者ID“C47P8thinOriginal”的载玻片图像。未感染类的CSV文件包含201个条目,因为来自感染患者的载玻片的正常细胞也使其达到正常细胞类别(151 + 50 = 201)。

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数据与出版物一起出现:
Rajaraman S,Antani SK,Poostchi M,Silamut K,Hossain MA,Maude,RJ,Jaeger S,Thoma GR。(2018)预先训练的卷积神经网络作为特征提取器,用于改善薄血涂片图像中的疟疾寄生虫检测。PeerJ6:e4568 https://doi.org/10.7717/peerj.4568 dedecms.com

数据集可在cell_images.zip,在码malaria_cell_classification_code.zip病人-ID和在细胞的寄生的和未感染的类映射patientid_cellmapping_parasitized.csv和patientid_cellmapping_uninfected.csv分别。 本文来自织梦

作者:Stefan Jaeger博士 copyright dedecms

下载地址:

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